Vaksinasi yang diberikan sewaktu usia kanak-kanak biasanya selamat[12] dan kesan buruk yang ada selalunya wujud pada tahap yang sederhana;[13] hal sedemikian kerana tubuh badan bertindak balas menghadapi agen yang disangka menjangkit dan membahayakan badan.[14]

Kadar kesan sampingan yang wujud bergantung kepada jenis vaksin itu sendiri. Kesan yang biasa dan lazim termasuk demam, kesakitan di ruang sekitar serta otot tempat suntikan, mual, sakit kepala dan muntah.[14] Sesetengah individu juga boleh mempunyai alahan terhadap bahan-bahan yang ada dalam vaksin.[15]

Kesan sampingan yang ketara amat jarang sekali berlaku.